MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 1795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	AGC	2	6	17	22	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
2	NC_010935	CG	3	6	40	45	0 %	0 %	50 %	50 %	190571921
3	NC_010935	GCC	2	6	59	64	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571921
4	NC_010935	AAG	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571921
5	NC_010935	GATG	2	8	130	137	25 %	25 %	50 %	0 %	190571921
6	NC_010935	GAC	2	6	151	156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
7	NC_010935	CAG	2	6	246	251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
8	NC_010935	CGG	2	6	273	278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571921
9	NC_010935	G	6	6	317	322	0 %	0 %	100 %	0 %	190571921
10	NC_010935	GAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571921
11	NC_010935	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
12	NC_010935	GAT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571922
13	NC_010935	CCA	2	6	488	493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571922
14	NC_010935	CGC	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571922
15	NC_010935	CAT	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
16	NC_010935	CGA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571922
17	NC_010935	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
18	NC_010935	TCA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
19	NC_010935	TCGT	2	8	700	707	0 %	50 %	25 %	25 %	190571922
20	NC_010935	GCT	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571922
21	NC_010935	TGG	2	6	773	778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
22	NC_010935	GTC	2	6	787	792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571922
23	NC_010935	CGG	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
24	NC_010935	GTG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
25	NC_010935	ACA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571922
26	NC_010935	CAT	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
27	NC_010935	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571922
28	NC_010935	CAG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571922
29	NC_010935	CGG	2	6	1139	1144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
30	NC_010935	GCGA	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	190571923
31	NC_010935	CGA	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571923
32	NC_010935	TCC	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571923
33	NC_010935	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571923
34	NC_010935	G	6	6	1342	1347	0 %	0 %	100 %	0 %	190571923
35	NC_010935	GGC	2	6	1391	1396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
36	NC_010935	CGG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
37	NC_010935	GCC	3	9	1440	1448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
38	NC_010935	GCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
39	NC_010935	GCC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
40	NC_010935	CGC	2	6	1490	1495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
41	NC_010935	GCGCG	2	10	1509	1518	0 %	0 %	60 %	40 %	190571923
42	NC_010935	GGC	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
43	NC_010935	GCC	2	6	1563	1568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
44	NC_010935	GCCTGC	2	12	1838	1849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571924
45	NC_010935	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571924
46	NC_010935	GCC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571924
47	NC_010935	GC	3	6	1943	1948	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
48	NC_010935	CCTT	2	8	1997	2004	0 %	50 %	0 %	50 %	190571924
49	NC_010935	GC	3	6	2047	2052	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
50	NC_010935	CTG	3	9	2053	2061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
51	NC_010935	CTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
52	NC_010935	CTG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
53	NC_010935	GC	3	6	2140	2145	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
54	NC_010935	CTG	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
55	NC_010935	GGC	2	6	2254	2259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
56	NC_010935	TGC	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
57	NC_010935	CAG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571924
58	NC_010935	CGG	2	6	2319	2324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
59	NC_010935	CTG	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
60	NC_010935	TTG	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571924
61	NC_010935	CGG	2	6	2358	2363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
62	NC_010935	GCG	2	6	2377	2382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
63	NC_010935	CGGC	2	8	2393	2400	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
64	NC_010935	GGTG	2	8	2401	2408	0 %	25 %	75 %	0 %	190571924
65	NC_010935	GTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
66	NC_010935	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571925
67	NC_010935	GC	3	6	2510	2515	0 %	0 %	50 %	50 %	190571925
68	NC_010935	CTG	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571925
69	NC_010935	GTT	2	6	2613	2618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571925
70	NC_010935	CTT	2	6	2652	2657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571925
71	NC_010935	CTG	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571925
72	NC_010935	CTT	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571925
73	NC_010935	CGC	2	6	2986	2991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
74	NC_010935	GCCG	2	8	3037	3044	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
75	NC_010935	CTGG	2	8	3071	3078	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
76	NC_010935	CCT	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
77	NC_010935	GC	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
78	NC_010935	GCT	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
79	NC_010935	GCT	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
80	NC_010935	GCC	3	9	3246	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
81	NC_010935	CTG	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
82	NC_010935	GCC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
83	NC_010935	GCTC	2	8	3312	3319	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
84	NC_010935	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
85	NC_010935	CCGGC	2	10	3339	3348	0 %	0 %	40 %	60 %	190571926
86	NC_010935	GCC	2	6	3378	3383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
87	NC_010935	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
88	NC_010935	CGCTC	2	10	3447	3456	0 %	20 %	20 %	60 %	190571926
89	NC_010935	CCT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
90	NC_010935	GCC	2	6	3528	3533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
91	NC_010935	CGCT	2	8	3534	3541	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
92	NC_010935	CCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
93	NC_010935	GC	3	6	3677	3682	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
94	NC_010935	CGG	2	6	3724	3729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
95	NC_010935	GTT	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571926
96	NC_010935	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
97	NC_010935	CGC	2	6	3803	3808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
98	NC_010935	GCC	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
99	NC_010935	TGGC	2	8	3837	3844	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
100	NC_010935	CGC	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
101	NC_010935	GCT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
102	NC_010935	CGG	2	6	3940	3945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
103	NC_010935	TCG	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
104	NC_010935	CAG	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
105	NC_010935	CGGC	2	8	4286	4293	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
106	NC_010935	CGG	2	6	4297	4302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571927
107	NC_010935	CGGGC	2	10	4315	4324	0 %	0 %	60 %	40 %	190571927
108	NC_010935	GTC	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
109	NC_010935	GAT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
110	NC_010935	CGGGT	2	10	4368	4377	0 %	20 %	60 %	20 %	190571927
111	NC_010935	CTT	3	9	4389	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
112	NC_010935	TCC	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571927
113	NC_010935	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571927
114	NC_010935	TCC	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571927
115	NC_010935	GCA	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
116	NC_010935	CG	3	6	4538	4543	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
117	NC_010935	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
118	NC_010935	GCCA	2	8	4564	4571	25 %	0 %	25 %	50 %	190571927
119	NC_010935	TTC	2	6	4591	4596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
120	NC_010935	TGA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
121	NC_010935	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
122	NC_010935	TG	3	6	4699	4704	0 %	50 %	50 %	0 %	190571927
123	NC_010935	CTT	3	9	4746	4754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
124	NC_010935	CGTTG	2	10	4808	4817	0 %	40 %	40 %	20 %	190571927
125	NC_010935	TGG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571927
126	NC_010935	TGA	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
127	NC_010935	CGC	2	6	4982	4987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
128	NC_010935	CCG	2	6	5045	5050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
129	NC_010935	TCG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
130	NC_010935	GCC	2	6	5103	5108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
131	NC_010935	CGC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
132	NC_010935	CTT	3	9	5217	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
133	NC_010935	GC	3	6	5292	5297	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
134	NC_010935	GC	3	6	5315	5320	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
135	NC_010935	CG	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
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261	NC_010935	AAC	2	6	12218	12223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571940
262	NC_010935	CTTG	2	8	12324	12331	0 %	50 %	25 %	25 %	190571940
263	NC_010935	GCC	2	6	12394	12399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571940
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391	NC_010935	CGG	2	6	19435	19440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571946
392	NC_010935	CGAG	2	8	19471	19478	25 %	0 %	50 %	25 %	190571946
393	NC_010935	GGC	2	6	19480	19485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571946
394	NC_010935	AAG	2	6	19517	19522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571946
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499	NC_010935	GCC	2	6	24523	24528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571951
500	NC_010935	TCA	2	6	24590	24595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571951

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